Bien qu'ils utilisent le même type de connexion, le port souris (proche du connecteur vidéo) et le port joystick (proche du connecteur clavier)  véhiculent des signaux très différents:

1 NC                  6 NC	1 YA               6 Clic gauche
2 Manette 2           7 Manette 1	2 XA               7 Masse
3 Haut                8 Bas	3 YB               8 +5V
4 Bouton de tir       9 Droit	4 XB               9 Clic droit
5 Gauche	5 Clic central
1 Horloge       4 Masse	1 +12V            5 Rouge
2 Données       5 +5V	2 Masse           6 Vert
3 Reset	3 Sortie Audio    7 Bleu
	4 Vidéo comp.     8 Sync

Le  cavalier JM5 (situé près du connecteur vidéo DIN) définit le mode vidéo actif.
- En position 3-1, la carte fonctionne en mode RVB
- En position 1-2, la carte fonctionne en mode composite (NTSC) 

 JM5          JM5 en mode RVB         JM5 en mode composite
o o o              o-o o                     o o-o
3 1 2              3 1 2                     3 1 2
 

Le brochage du bus d'extension est documenté à la page dédiée à la Pebox.